Specjalistki Szkoły Podstawowej nr 2 im. Józefiny i Emila Mików w Lipnicy Wielkiej: Agata Skoczyk (logopeda, neurologopeda) oraz Justyna Kulawiak (pedagog) brały udział w ogólnopolskim projekcie „Szkoła dostępna dla wszystkich”, realizowanym przez Instytut Badań Edukacyjnych (IBE).
W klasie 0A i 0B zakończyła się realizacja innowacji pedagogicznej pt. „Logoprymki w świecie mowy”, której celem było usprawnienie pracy narządów artykulacyjnych u dzieci oraz wspieranie podstawowych funkcji prymarnych takich jak: oddychanie, połykanie, gryzienie i żucie, a także rozwój mięśni mimicznych, tak ważnych dla prawidłowego rozwoju mowy.
W roku szkolnym 2024/2025 uczniowie z klasy II i IIIa wzięli udział w Ogólnopolskim Projekcie Edukacyjnym „Natalka i Antek w Świecie Wielkiej Matematyki”.
Klasa IIIa realizowała w bieżącym roku szkolnym innowację pedagogiczną „Mały ekolog”. Inspiracją do realizacji programu innowacyjnego o takiej tematyce były zauważalne zmiany zachodzące w środowisku naturalnym, związane z rozwojem cywilizacji.
W Szkole Podstawowej nr 2 im. Józefiny i Emila Mików w Lipnicy Wielkiej została przeprowadzona innowacja pedagogiczna z języka niemieckiego pt. „Nauka i zabawa mogą iść w parze – nauka języka niemieckiego na wesoło”. Innowacja realizowana była w kl. VII-VIII w okresie od kwietnia do czerwca 2025 r.